El primer propulsor del nuevo Audi Q5 en ponerse a la venta será el 40 TDI, que se acompaña de un cambio S tronic de 7 velocidades y del sistema de tracción total quattro. Este bloque de dos litros y cuatro cilindros ahora emplea un nuevo cárter de aluminio que ahorra 20 kilos de peso, además de un cigüeñal que resta otros 2,5 kilos. Como todos los actualizados motores TDI, esta versión ahora cuenta con el sistema SCR dual, que cuenta con dos inyectores de AdBlue en su línea de escape para minimizar al máximo las emisiones de NOx.